私の修士課程における研究目的は、より精密な心室筋細胞・電気生理学モデルの構築、及び、心室筋虚血状態におけるシミュレーション解析すなわちin silico実験(コンピュータ上に構築したモデルを用いて薬物投与などの様々な条件下での振る舞いを予測し、細胞の機能や役割を分析する実験)である。 |
はじめに 心筋細胞には、膜電位や筋収縮といった、多くの事象を統合的に眺められるシンプルな出力があり、またパッチクランプ法による単分子の膨大なデータがある。しかし、心筋細胞内の機能と要素間の相互作用、心筋代謝、興奮連関において、未だ解明されていないことは多く、その機能解明が求められる。 虚血とは、血流の減少による酸素や糖分の欠乏を入力刺激とし、拍動や収縮力の異常を出力とする現象と捉えられる。ATPの産生、消費の両側面を含むモデルを用いることで、細胞レベルでの虚血を俯瞰的に解析できることが期待され、虚血がもたらす細胞内の機能や諸要素の相関関係の変化について、入力・出力を含めた範囲での解析を試みたい。 心室筋細胞の虚血状態時における病態解析に向け、春学期はKATPによる心筋保護作用の関わりについてイオンチャネルを中心に検証を行った。その過程、及び、結果より得られた考察と問題点については、後述する。また心室筋細胞の虚血状態のシミュレーションを実現する上で、ATPの動態を動的にモデル化することは欠かせない。そこで秋学期には、心筋興奮−収縮モデル(以下、 Kyoto model)[1][2]を用いて、心室筋細胞の虚血状態のシミュレーションを実現するために、エネルギー代謝経路の実装に取り組んだ。Kyoto modelは、筋収縮等のATP消費について精密なモデル化がなされているので、消費を相補するATP産生モデルとして、酸素や糖分を受け取ってATPを産生する、解糖系、TCA回路、酸化的リン酸化経路を中心としたエネルギー代謝経路の実装を行った。細胞膜による基質の輸送調節や、ミトコンドリア膜による還元当量の輸送調節機構が統合されて、心臓はいついかなる状態においても基質を至適に利用できるようにエネルギー産生速度を調節する。ATP産生から消費されるまでの一連の作用とバランスをE-CELL System上に構築し、活動電位形成との相関を検証した。
〜KTPチャネルの活性化と細胞内要素の相関に関する検証〜 心筋虚血とその発生機序 心筋虚血とは心臓を養う血管の動脈硬化等により、心臓に十分酸素が供給されない状態を指す。(よく心臓発作と言うが、完全に動脈が閉塞して心筋の一部が壊死してしまった場合を心筋梗塞と言い、狭心症はその前段階であり、放っておくと心筋梗塞になる可能性が高い病態である。 細胞の酸素消費量が増加するにつれて、1個の心筋細胞の中心部に酸素不足領域ができ、それがミトコンドリアの代謝を抑制する。心筋では、酸素分子は細胞表面から細胞中心まで約10ミクロンの距離を拡散すればよいのだが、この距離は、酸素分子にとって長い道のりであり、従って、特にこの道のりの終着点である細胞中心部に位置するミトコンドリアでは、酸素需要が高まると、拡散による酸素供給が追いつかなくなってしまうのである。
考察 (1) @ ATP濃度減少に伴い、KATPチャネルは活性化し、活動電位が短縮することが確認された。これは心筋細胞内のATP不足により、KATPチャネルが活性化され、心筋の活動電位の持続時間を短縮したと考える。 A 電位依存性チャネルである、ICaL、INa、IKr、IKs、IRK1、ICaT、Na+/K+ pump、Na+/Ca2+Exchangerはすべて、第2〜3相付近での電流発生時間幅の短縮が見られた。これは膜電位によってフィードバックがかかったと考える。 B Na+/K+ pumpもNa+/Ca2+ ExchangerもATPに依存した調節機能をもつ。今回、ATP濃度の減少に伴う電流量の増加を確認することができた。 C 一方、SR Ca2+Uptakeは仮説に反し、ATP濃度の減少に伴い、電流量が増加することはなく、むしろばらつきが見えた。活動電位を短くすることでCa2+の流入を抑え、ATPの消費を極力抑えようとする心筋保護作用が働いていると考えられる。しかし、細胞内のCa2+濃度の抑制やAPDやKATPチャネルの活性化との相関が見られなかった。 〜ミトコンドリア・エネルギー代謝経路モデルの実装〜 心筋細胞のミトコンドリアについて ミトコンドリアの最大の機能は、電子伝達系によりミトコンドリア膜間腔(内膜・外膜間)のプロトン濃度を高め、濃度勾配によるミトコンドリア内へのプロトンイオンの排出を駆動力として、ATP合成酵素によりATPを産生することである。 ミトコンドリアによるCa2+取り込みは、内部が負に分極しているミトコンドリア膜電位に依存しており、これを行う分子はmitochondrial Ca2+ uniporter (mCU)と呼ばれている。一方、Na+依存性にミトコンドリアからCa2+を排出する蛋白もあり、これはmitochondrial Na+/Ca2+exchanger (mNCE)という。もう一つ、mitochondrial permeability transition pore (mPTP)と呼ばれる透過性の高いチャネルがある。mPTPは生理的条件下では開口しないことはわかっているが、未だ解明されていない点も多い。その他に、Rapid uptake modeと呼ばれる、細胞質のCa2+濃度の振動に応じて働くトランスポーターがある。また、Na+非依存性のCa2+排出機構があるとの説もある。
![]() Table1: Steady State Parameters
2003年度学会発表 [1]Miyamoto, S., Naito, Y., Yoneda, M., Ishinabe, S., Sarai, N., Matsuoka, S., Noma, A., Tomita, M., Electrophysiological Simulation of Ventricular Cell Using E-CELL System and in preparation for construction ischemic state model., First IECA Conference on Systems Biology of E.coli(2003 Tsuruoka) [2]Motohiro Yoneda, Shoko Miyamoto, Yasuhiro Naito, Sayaka Ishinabe, Nobuaki Sarai, Satoshi Matsuoka, Akinori Noma, Masaru TomitaModel Construction of the Energy Metabolism Pathway in Myocardial Cell, International Conference On Genome Informatics.(2003 Yokohama) [3]Miyamoto, S., Naito, Y., Yoneda, M., Ishinabe, S., Sarai, N., Matsuoka, S., Noma, A., Tomita, M., 虚血状態のシミュレーションに向けた心室筋細胞モデルの拡張., 第26回日本分子生物学会年会.(2003) |