2012年度 森基金 成果報告書

政策・メディア研究科 修士課程 2年 (BI所属)
大下 和希

Student ID : 81124288


研究課題名 : 遺伝子を中心としたシステム生物学情報の効率的統合

要旨

バイオインフォマティクス分野では数多くのデータベースや解析Webサービスがオンラインで公開されており,多くの研究者がそれらWebリソースから生物学リソースを取得し解析を行ってこれらのリソースを用いてより効率的な解析を行うため,解析Webサービスの連携による複雑かつ高度な解析フローの構築や,多領域生物学データベースおよびWebサービスの効率的な統合と運用を行うシステムの構築が求められてきた.そのため,本論文では解析・データアクセスWebサービス群と各種データベースを対象に,それぞれを効率的に統合し運用することを目的としたシステムの設計・構築を行った.G-Linksは生物学Webリソースを効率的に統合し,そこからユーザが必要な生物学データセットを高速かつ自動的に抽出するシステムである.G-Linksでは多領域生物学情報に対して遺伝子集約型のデータ統合モデルとID変換をベースとした統合を行っており,URLにアクセスするだけでユーザが対象とする遺伝子に関する生物学情報セットを高速に収集し,得られた情報セットからユーザが必要な情報だけを抽出,任意のフォーマットへ変換というプロセスを高速かつ自動で行うことができる.本システムは http://link.g-language.org/ より利用できる.これらのデータ統合プラットフォームを用いることで,研究者は多領域に渡る大量の生物学Webリソースから,生命システムに関する知識をより効率的に導出することが可能となる.


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