研究成果報告書

バイオインフォマティクスプログラム(BI) 修士1年
学籍番号80332223 中村 征良

タンパク質間相互作用(Protein-Protein Interaction:PPI)データの抽出と解析

春学期活動報告書(英語):Development of Method to Predict Protein Function of Escherichia coli Using Protein Complex Data

秋学期活動報告書(日本語):ベイズ統計を用いた大腸菌PPIの精製と予測



2003年度の学会発表(2月21日現在)

・"Development of method to predict protein function of Escherichia coli using protein complex data."
Seira Nakamura, Rintaro Saito, Takeshi Ara, Aya Itoh, MD Arifuzzaman, Maki Maeda, 
Taku Oshima, Shigehiko Kanaya, Chieko Wada, Hirotada Mori, Masaru Tomita
◎First International E.coli Alliance Conference on Systems Biology of E.coli, 2003

・"Genome-wide analysis of protein-protein interactions in Escherichia coli"
  Md. Arifuzzaman, Maki Maeda, Takita Chiharu, Taku Oshima, Aya Itoh, Shigehiko Kanaya, Altaf-Ul-Amin, Hikaru Kimura, Seira Nakamura, Rintato Saito, Masaru Tomita, 
Chieko wada, Hirotada Mori
◎First International E.coli Alliance Conference on Systems Biology of E.coli, 2003

・"Prediction of Interacting Motif from Protein-Protein Interaction Data of Escherichia coli."
Hikaru Kimura, Seira Nakamura, Rintaro Saito, Takeshi Ara, Aya Itoh, Md. Arifuzzaman, 
Maki Maeda, Taku Oshima, Shigehiko Kanaya, Chieko Wada, Hirotada Mori, Masaru Tomita
◎First International E.coli Alliance Conference on Systems Biology of E.coli, 2003

・「大腸菌タンパク質間相互作用データの精製とタンパク質の機能予測」
"Development of Method to Predict Protein Function of Escherichia coli Using Protein Complex Data"  
中村征良 斎藤輪太郎 荒武 伊藤文 Md.Arifuzzaman 前田真希 大島拓 和田千恵子 森浩禎 冨田勝  
◎情報計算化学生物学会 Chem-Bio Informatics Society 2003年大会  
○New Frontiers for Chem-Bio Informatics, P238, 2003  


・"Prediction of Motif-Motif Interaction and Protein-Protein Interaction in Escherichia coli."  
Hikaru Kimura, Seira Nakamura, Rintaro Saito, Takeshi Ara, Aya Itoh, Md. Arifuzzaman, Maki Maeda, Taku Oshima, Chieko Wada, Hirotada Mori, Masaru Tomita  
◎情報計算化学生物学会 Chem-Bio Informatics Society 2003年大会  
○New Frontiers for Chem-Bio Informatics, P239, 2003  

・"Development of Method to Predict Protein Function of Escherichia coli Using Protein Complex Data."  
Seira Nakamura, Rintaro Saito, Takeshi Ara, Aya Itoh, Md. Arifuzzaman, Maki Maeda, Taku Oshima, Chieko Wada, Hirotada Mori, Masaru Tomita  
◎International Workshop for Escherichia coli Towards New Biology in the 21st Century  
○Systematic functional analysis for Escherichia coli genome - resorces, systems approach and towards modeling -, P.91, 2003  

・"Prediction of Motif-Motif Interaction and Protein-Protein Interaction in Escherichia coli."  
Hikaru Kimura, Seira Nakamura, Rintaro Saito, Takeshi Ara, Aya Itoh, Md. Arifuzzaman, Maki Maeda, Taku Oshima, Chieko Wada, Hirotada Mori, Masaru Tomita  
◎International Workshop for Escherichia coli Towards New Biology in the 21st Century  
○Systematic functional analysis for Escherichia coli genome - resorces, systems approach and towards modeling -, P.96, 2003  

・"Refinement and Mining of Protein-Protein Interaction Network in Escherichia coli."  
Rintaro Saito, Seira Nakamura, Hikaru Kimura, Kohei Tsuzuki, Tomoko Takeda, Daisuke Kyuma, Yusuke Kobayashi, Shigeo Fujimori, Takeshi Ara, Aya Itoh, Md. Arifuzzaman, Maki Maeda, Taku Oshima, Chieko Wada, Hirotada Mori, Masaru Tomita  
★International Workshop for Escherichia coli Towards New Biology in the 21st Century  
○Systematic functional analysis for Escherichia coli genome - resorces, systems approach and towards modeling -, P.64, 2003  

・「大腸菌タンパク質間相互作用データの精製とタンパク質の機能予測」  
中村征良 斎藤輪太郎 荒武 伊藤文 Md.Arifuzzaman 前田真希 大島拓 和田千恵子 森博禎 冨田勝  
◎第26回日本分子生物学会年会2003  
○第26回日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集P.685  

・「大腸菌におけるモチーフ間相互作用とタンパク質間相互作用の予測」  
木村曜 中村征良 斎藤輪太郎 荒武 伊藤文 Md.Arifuzzaman 前田真希 大島拓 和田千恵子 森博禎 冨田勝  
◎第26回日本分子生物学会年会2003  
○第26回日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集P.686  

◎:学会発表 ○:学会内出版 ●:学内論文集