転写制御遺伝子スプライスバリアントのPPI解析

 転写因子として知られているFosはJun b-ZIPモチーフ領域との相互作用が知られて おりIVV法を用いた実験においても同様の結果が確認された.本研究で用いたFosスプ ライスバリアントはb-ZIPモチーフのうちDNAとの結合領域全域(basic region)及び ロイシンジッパー(Leucine zipper)において5回繰り返されるロイシンについてN末端 側の1回分を欠く.これによってPPIには強弱の変化がタンパク質-DNA相互作用 (Protein-DNA Interaction; PDI)についてはON/OFFの変化が確認されると予想さ れた.またこのスプライスバリアントは膵臓および骨髄由来のEST(Expressed Sequence Tag)に基づいており,公共の選択的スプライシングデータベースの中ORFが定義され ているという特徴をもつASAP (Lee et al., 2003)にもエントリーされていることから 多くの情報を有しているといえる.しかしPPIおよびPDI変化とそれに伴う表現型への影 響に関する先行研究は存在していない.PPI解析においてはIVV実験によってPPIが確認さ れているJun b-ZIPモチーフ領域に対してFos全長,Fosスプライスバリアント及びFos b-ZIPモチーフ由来タンパク質の3サンプルについてプルダウン法を用い蛍光標識した Jun b-ZIPとの相互作用を確認した(図3).

図3 (以下、図の説明)
 本研究で用いたFosスプライスバリアントは’cassette’型といわれる選択的スプラ イシングパターンをとっており,PDI領域全域,PPI領域の一部を欠く.この変化に伴い IVV先行実験によって特定されたJun b-ZIPに対する結合,DNAのAP-1結合領域 (Fos・Jun複合体結合領域)に対する結合が変化すると予想された.図には全長, スプライスバリアント,Fos b-ZIPについて予想されたPPIに関する概念図を示す.
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